Mikroorganizma, boyutları çıplak gözle görülemeyecek kadar küçük olan organizmalardır. İnsan gözünün çözünürlüğü 0,2 mm'dir ve bu, mikroorganizmaların maksimum boyutu için yapay bir sınır olarak 1 mm'yi belirler. Mikroorganizmalar arasında hepsi tek hücreli olan veya gerçek dokuları olmayan prokaryotlar (bakteri ve arkeler), ökaryotlar (protistler, mikroskobik algler ve mantarlar) bulunur.¹